Ahoj,
šablony pro transakční emaily jsou uložené jinde, u 1.9.x konkrétně zde:
/app/locale/cs_CZ/template/email
Pokud je tam takováto chyba, tak tu bychom měli přeložit přímo v oficiální Magento lokalizaci (co na tom děláme, já mám řadu oprav pro email templates, ale zatím jsem se nedostal k publikaci, páč s těmi templates se na crowdinu teda pracuje dost blbě).
Dalším řešením je pak udělat si klon emailové šablony přímo z v adminu atam si šablonu upravit, tedy v adminu:
System / Transactional Emails / Add New Template
Vybrat template a locale a tu si upravit dle svých potřeb. Pak se bude používat (pro vybrané položky) tato upravená šablona.